Кафедра анатомии, физиологии и зоогигиены была основана в 1955 году и была образована  на базе двух ранее кафедр: кафедры анатомии, зоогигиены и кафедры физиологии.

 В становление кафедры плодотворное влияние оказали видные ученые страны -  член-корр. АН Казахской ССР, профессор  С.Н. Боголюбский, заслуженный деятель науки РСФР, д.с.-х. наук, профессор Г.И.Азимов.,

заслуженный деятель науки, лауреат Государственной премии СССР, д.в.н., профессор П.А.Величкин, д. веет. н., профессор Н.Д. Кракосевич, д.б.н., профессор В.А.Першин , к.б.н.,  профессор В.В. Арепьев. 

В настоящее время кафедру возглавляет доктор ветеринарных наук, профессор Р.А.Камалов. 

В разные годы на кафедре преподавали и занимались научной работой профессора  Р.В.Клер, Н.А.Флегматов, Г.В.Казеев, А.А.Ибрагимов, доценты Б.А.Артеменко,  М.Д.Липинер, О.П.Белугина, В.А.Пчелина, В.Ф.Голубков, проходил аспирантуру основоположник трансплантологии на собаках В.П.Демихов.

На кафедре работают – профессора А.А.Тагиев, В.В.Арепьев, М.Д.Гельберт; доценты – Ю.А.Великовская, Т.В.Кракосевич, О.В.Першина, ассистент М.В.Прохазка.